【資工碩士班】
1、必選科目為：「正規語言與自動機理論」、「計算機演算法」。(二科一律不可抵免)
2、必修科目為：「研究方法」。
【資網碩士班】
必修科目為：「研究方法」、「資訊網路與多媒體」、「雲端計算」。
【全英語碩士班】
必修科目為：「Research Methodology」、「Advanced Computer Algorithms」。
★碩士班課程互選規章【105學年度第2學期第1次系務會議修正通過】
1、依本校研究生選課須知第八條第（一）款：研究生應修之科目，係屬他系所、他校開者，必須經所屬學系所主任、他系所主任及任課老師同意。除基礎科目外，最多以6學分為限。
2、本系博士班學生可選修本系碩士班開設之科目，最多以9學分為限。
3、資工碩士班、資網碩士班及全英語碩士班(限全英語授課之科目)學生可選修本系博士班開設之科目，全部承認為選修學分。
4、本系碩士班(資工碩士班、資網碩士班、全英語碩士班)互選學分全部列入畢業學分數計算(全英語碩士班僅承認全英語授課之科目為選修學分數)。