淡江大學資訊工程學系成立於民國58年，以推廣計算機應用教育、培育國家及社會建設之高級資訊人才為目標，進而提升國 內資訊工業水準。本系原名『電子計算機科學學系』，是國內最早創立之資訊相關科系；民國59年設立夜間部、67年成立研究所碩士班、78年成立博士班。
為了符合時代需求，民國81年正式更名為『資訊工程學系』，目前有大學日間部、進學班，研究所碩士班、博士班；為強化教育體系在職進修功能，於90學年成立碩士在職專班；為期培養更精進專業的網路與通訊人才，95學年增設成立『資訊網路與通訊碩士班』(104學年度改名『資訊網路與多媒體碩士班』、110學年度改名『智慧計算與應用碩士班』)；為培育具國際視野的資通訊人才及吸收優秀的國際學生，103學年度增設立『全英語碩士班』；110學年度本系與資訊創新與科技學系整併為資訊工程學系，整併後新增『全英語學士班』。在教學方面，理論與實際並重，課程涵蓋實務及研究性質。
本系大學部於106學年申請『中華工程教育認證』第三週期性審查並獲得通過，印證了本系的教育品質與人才培育之成效。
-1969年成立大學日間部
-1971年成立大學夜間部(1998年轉型進修學士班)
-1978年成立研究所碩士班 （現在名稱為資訊工程學系碩士班）
-1989年成立研究所博士班 （現在名稱為資訊工程學系博士班）
-1993年系所合一
-2001年成立資訊工程學系碩士在職專班
-2006年成立資訊工程學系資訊網路與通訊碩士班
-2014年成立資訊工程學系全英語碩士班
-2015年資訊工程學系資訊網路與通訊碩士班更名為資訊工程學系資訊網路與多媒體碩士班
-2021年資訊工程學系與資訊創新與科技學系整併為資訊工程學系，整併後新增全英語學士班
-2021年資訊工程學系資訊網路與多媒體碩士班更名為資訊工程學系智慧計算與應用碩士班